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Genoma del cáncer: el mapa más preciso hasta la fecha

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Un equipo internacional que incluye investigadores de la Universidad McGill acaba de poner la última mano en estudio más detallado hasta la fecha sobre los genomas de cáncer completo. Nuestra comprensión del cáncer se especifica considerablemente y se dibujan nuevas vías de diagnóstico y tratamiento.

El estudio PCAWG (análisis PAN-CANTERIOR DE PROYECTO DE GENOMES entero, se llevó a cabo mejor como el nombre «PAN-CÁNCER») Por la asociación ICGC / TCGA, reuniendo a más de 1,300 científicos y médicos de 37 países. Este equipo analizó más allá de 2,600 genomas correspondientes a 38 tipos de tumores y, por lo tanto, constituía una megabase de datos genómicos sobre los cánceres primitivos. Posteriormente, 16 grupos de trabajo se centraron en múltiples aspectos de la ocurrencia, progresión, progresión y clasificación del cáncer.

Los estudios anteriores llevaban en la parte del genoma que codifica la proteína, o el 1% del genoma: es Un poco como la franja costera de un continente. El equipo de PCAWG, se llevó a cabo en el resto del genoma, particularmente en las regiones de la primera importancia capaz de activar y deshabilitar genes: aquí, no solo rastramos la costa, sino que colocamos todo el mapa del continente.

Compartiendo un corpus para la búsqueda de genómica del cáncer

Gracias al estudio PCAWG, ahora tenemos un cuerpo completo para la investigación de la genómica del cáncer: Datos de secuenciación del genoma, software de análisis del genoma del cáncer y múltiples sitios web interactivos que exploran los datos del estudio de todas sus costuras.

El equipo de este estudio ha perfeccionado el análisis de los genomas de cáncer mediante el uso de métodos innovadores, incluida la nube, y luego la aplican a su amplio conjunto de datos, se ha descubierto sobre la biología del cáncer y se confirmó importantes Hallazgos de estudios previos. Aquí está lo que emerge de los 23 artículos recién publicados en Naturenet sus revistas de afiliados:

  • de la complejidad extrema, el genoma del cáncer no constituye un mínimo de un conjunto finito, accesible al conocimiento. Desde toda la secuencia del genoma y una serie de herramientas de análisis, no solo podemos caracterizar a cada modificación genética relacionada con el cáncer y todos los procesos que condujeron a esta mutación, sino que también determinan el orden de ocurrencia de grandes eventos de la existencia de cáncer.
  • Los investigadores pronto habrán enumerado todas las rutas biológicas en juego en el cáncer y tendrán un retrato más completo de su papel en el genoma. Observaron una mutación causal en casi todos los cánceres analizados y observaron la enorme diversidad de procesos mutagénicos, que pueden pasar de un simple cambio de cartas de ADN a la reorganización de cromosomas completos. Finalmente, han identificado muchas regiones del genoma que gobiernan la activación y la inactivación de los genes y serían el asiento de las mutaciones carcinogénicas.

  • gracias a un método innovador de «citas con radiocarburos. «, Los investigadores han descubierto que era posible detectar cambios que ocurren años, a veces incluso décadas, antes de la aparición de un tumor. Que abre, al menos en teoría, perspectivas interesantes para la detección temprana del cáncer.
  • Podemos determinar con precisión qué tipo de tumor estamos tratando con los cambios que se observan genéticos observados en el genoma. Esta información podría ser útil para el diagnóstico, cuando las pruebas clínicas habituales no revelan nada de tumor, y para la posible adaptación del tratamiento al tipo de tumor en cuestión.

«» estamos Aquí, delante del fruto de docenas de años de colaboración y intercambio de datos … pero dada la reciente entrada en vigor del Reglamento General sobre la protección de datos de Europa, ¿sigue siendo posible mapear el cáncer? Los pacientes ‘hoy y mañana son ahora ¿Protegido a sus cuerpos defensores? ¿Ha estado llamando a los gras de acceso sin obstáculos a los recursos científicos? El mundo tendrá que dar un código de conducta internacional para contrarrestar estos posibles obstáculos para el mapeo de enfermedades que tienen solo para hacer este tipo de convenciones «, Dichos Knoppers de PRE BARTHA MARIA, director de la Universidad McGill y Centro de Políticas y Coautor del Estudio.

Para obtener más información En este estudio, consulte la Naturaleza de la revista.

Más información

ICGC – Consorcio del genoma del cáncer internacional (https://icgc.org/)

tcga – El Atlas del genoma del cáncer ( https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga)

PCAWG – Análisis pan-cáncer de los genomas enteros (dcc.icgc.org/pacawg)

UCSC – University California a Santa cruz (pcawg.xenahubs.net)

expresión ATLAS (www.ebi.ac.uk/gxa/home)

pcawg-scout (pcawscout.bsc. ES)

Chromothripsis Explorer (compbio.med.harvard.edu/chromothrippsis)

McGill University

Fundada en 1821 en Montreal, Quebec, L McGill University está clasificado primero de Canadá Universidades que ofrecen programas médicos y de doctorado. Año tras año, se ubica entre las mejores universidades de Canadá y de todo el mundo. Reconocimiento de instituciones de educación superior en todo el mundo, McGill University ejerce actividades de investigación en dos campus, 11 facultades y 13 escuelas vocacionales; Cuenta con 300 planes de estudio y más allá de 40,000 estudiantes, incluidos más de 10,200 en los graduados. Acoge con satisfacción a los estudiantes de más de 150 países, sus 12,800 estudiantes internacionales que representan al 31% de su población estudiantil. Más allá de la mitad de los estudiantes de la Universidad McGill tienen una lengua materna que no sea la lengua materna, y alrededor del 19% son francófonos.

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