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Genoma de Câncer: O mapa mais preciso até a data

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Uma equipe internacional, incluindo pesquisadores da McGill University, acaba de colocar a última mão em estudo mais detalhada até hoje sobre genomas inteiras de câncer. Nosso entendimento do câncer é consideravelmente especificado e novos avenidos de diagnóstico e tratamento são desenhados.

O estudo de pcawg (análise do câncer do câncer de todo o projeto de genomas, mais conhecido como o nome “Pan-Cancer Project”) foi realizado pela parceria ICGC / TCGA, reunindo mais de 1.300 cientistas e médicos de 37 países. Esta equipe analisada além de 2.600 genomas correspondentes a 38 tipos de tumores e, portanto, constituiu uma megabase de dados genômicos sobre cancros primitivos. Posteriormente, 16 grupos de trabalho focados em vários aspectos da ocorrência, progressão, progressão e classificação de câncer.

Os estudos anteriores usavam por parte da proteína de codificação do genoma, ou 1% do genoma: é um pouco como a faixa costeira de um continente. A equipe de pcawg, foi realizada no restante do genoma, particularmente em regiões de primeira importância capaz de ativar e desabilitar genes: aqui, nós não apenas traçamos o litoral, mas colocamos todo o mapa continente.

Compartilhar um corpus para a pesquisa de genômica do câncer

Graças ao estudo de pcawg, agora temos um corpus completo para a pesquisa genômica do câncer: Genome sequenciando dados, software de análise do genoma do câncer e vários sites interativos explorando os dados do estudo de Todas as suas costuras.

A equipe deste estudo aperfeiçoou a análise de genomas de câncer usando métodos inovadores, incluindo a nuvem e, em seguida, aplicá-las ao seu vasto conjunto de dados, descobriu sobre a biologia do câncer e confirmou Conclusões de estudos anteriores. Aqui está o que surge dos 23 artigos recém-publicados em Naturenet seus periódicos afiliados:

  • de extrema complexidade, o genoma do câncer não constitui um menos um conjunto finito, acessível ao conhecimento. De toda a sequência do genoma e uma série de ferramentas de análise, não podemos apenas caracterizar cada modificação genética relacionada ao câncer e todos os processos que levaram a essa mutação, mas também determinam a ordem de ocorrência de grandes eventos da existência de câncer.
  • Os pesquisadores logo listaram todas as rotas biológicas em jogo no câncer e terão um retrato mais completo de seu papel no genoma. Eles observaram uma mutação causal em quase todos os cânceres analisados e observaram a enorme diversidade de processos mutagênicos, que podem ir de uma simples mudança de cartas de DNA para a reorganização de cromossomos inteiros. Finalmente, eles identificaram muitas regiões do genoma que governam a ativação e a inativação dos genes e seria a sede de mutações carcinogênicas.

  • graças a um método inovador de “datação de radiocarbono “, os pesquisadores descobriram que era possível detectar mudanças ocorrendo anos, às vezes até décadas, antes da aparência de um tumor. Isso abre, pelo menos em perspectivas de teoria, interessantes para a detecção precoce de câncer.
  • podemos determinar com precisão o tipo de tumor que estamos lidando com alterações genéticas observadas no genoma. Esta informação pode ser útil para o diagnóstico – quando os testes clínicos habituais não revelam nada tumor – e para a possível adaptação do tratamento ao tipo de tumor em questão.

” Aqui na frente do fruto de dezenas de anos de colaboração e compartilhamento de dados … mas dada a recente entrada em vigor do regulamento geral sobre a proteção de dados da Europa, é possível mapear o câncer? Os pacientes hoje e amanhã são agora protegidos aos seus órgãos defensores? Tocaram os GRAs de acesso desinativo aos recursos científicos? O mundo terá que dar um código de conduta internacional para combater esses possíveis obstáculos ao mapeamento de doenças que só precisam fazer esse tipo de convenção “, Diz o Pré Bartha Maria Knoppers, diretor da Universidade McGill e Centro de Políticas e co-autor do estudo.

Para mais informações Neste estudo, consulte a Natureza da revista.

Mais informações

ICGC – Consórcio Internacional do Genoma do Câncer (https://icgc.org/ TCGA – O genoma do câncer atlas ( https://www.cancer.gov/about-nci/organization/ccg/research/structural-genomics/tcga

pcawg – análise pan-cancer de genomas inteiras (dcc.icgc.org/pacawg)

UCSC – University California para Santa Cruz (pcawg.xenahubs.net)

expressão atlas (www.ebi.ac.uk/gxa/Home)

pcawg-scout (pcawscout.bsc. Es)

Chromothripsis Explorer (compbio.med.harvard.edu/chromard.edu/chromothrippsis)

McGill University

Fundada em 1821 em Montreal, Quebec, L McGill University é classificado em primeiro lugar canadense Universidades que oferecem programas médicos e doutorados. Ano após ano, ela está entre as melhores universidades do Canadá e em todo o mundo. A renomada instituição de ensino superior em todo o mundo, a McGill University exerce atividades de pesquisa em dois campi, 11 faculties e 13 escolas profissionais; Tem 300 currículos e além de 40.000 alunos, incluindo mais de 10.200 em graduados. Congratula-se com os alunos de mais de 150 países, seus 12.800 estudantes internacionais representando 31% de sua população estudantil. Além da metade dos estudantes da McGill University têm uma língua materna diferente do inglês, e cerca de 19% são francofones.

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